¿La llevaste a un veterinario de exóticos?
Lo único que se me ocurre que tenga es algún tipo de parásito o enfermedad de la piel tipo sarna u hongos. Le picará o molestará mucho e intenta aliviarse de esa manera. Yo la volvería a llevar a un veterinario, para que le cojan muestras de la piel que tiene con heridas y las analicen, para ver qué tiene. En función de eso te mandará un tratamiento u otro. Mi hámster tuvo sarna, y el veterinario me mandó unas pipetas que tenía que echarle una vez al mes en el cuello.
De momento, lava y desinfecta bien la jaula y todo lo que tengas en ella, y a ver qué te dice el vete.